中心建筑面积8500平方米，内设办公室、业务科、总务科、献血服务科、检验科、质控科、成分科、供血服务科、待检科、输血医学研究所和免疫遗传研究室，中心下设5个固定捐血站及多个捐血车采血点。现有职工170名，高级职称39名，中级职称32名。大专以上学历147人，卫生专业技术人员占83.5%。配备有大量的先进的采供血设备和营造良好舒适的采供血环境。深圳市血液中心在全国率先开展无偿献血工作，现已连续七届被授予“全国无偿献血先进城市”称号，并荣获“深圳市精神文明单位”称号。率先进行无偿献血立法，率先做到无偿献血100%满足临床用血。